Федерално министарство просторног уређења у садашњем облику егзистира од 2006. године када је Законом о федералним министарствима и другим тијелима федералне управе извршена реорганизација Федералних министарстава. До тада се у оквиру Федералног министарства просторног уређења, налазио и сектор Околиша.
 
У данашњем облику Министарство се фокусирало на основне дјелатности везане за просторно планирање Федерације, употреба земљишта на федералном нивоу, дугорочно планирање искориштавања природних ресурса те заштиту националних споменика и подручја са изразитим природним градитељским и културно-хисторијским значајем. Више информација о мисијама Министарства можете пронаћи овдје .
 
Да би вршило ове мисије, Министрарство је организовано у четири сектора чији шематски приказ организације можете видјети овдје. Кликом на појединачне дјелове шеме, показује се кратак опис дјелатности одговарајуће организационе јединице.
 
За обављање дјелатности министраства, буџетом Владе Федерације за 2008. годину предвиђа се 14,25 милиона КМ од чега 2,1 милиона КМ за рад министарства, 6,39 милиона марака за суфинансирање пројеката кантона и локалних заједница ради заштите културног и градитељског наслијеђа и 5,845 милиона КМ за Просторни план ФБиХ и Просторне планове подручја од посебног значаја за ФБиХ .